A Plataforma xurde do grupo de investigación ACUIGEN con máis de 30 anos de traxectoria e adscrito ao Departamento de Zooloxía, Xenética e Antropoloxía Física da Universidade de Santiago de Compostela. A súa actividade científica, centrada na Xenética aplicada á acuicultura e conservación de recursos biolóxicos, está avalada por publicacións internacionais, tesis doctorais e unha ampla participación en proxectos autonómicos, nacionais e internacionais.
Os estudos de ACUIGEN abarcan diversas especies acuáticas e pesqueiras, como peixes mariños e continentais (rodaballo, troita, robaliza, dourada, linguado, pescada), moluscos (mexillón, ameixa, ostra, berberecho) e crustáceos (lagostino, quisquilla), así como otras especies relacionadas con proxectos de conservación de recursos xenéticos de animais e plantas (vacún, porco, coello, oso pardo, mexillón de río, cabaliño de mar, castiñeiro, teixo, árnica, entre outros).
Nos primeiros anos, a plataforma ofrecía servizos básicos como a extracción e purificación de ácidos nucleicos, amplificacións de ADN mediante PCR, secuenciación Sanger e análise de fragmentos de ADN. Cos avances tecnolóxicos, tense incorporado técnicas de secuenciación de nova xeración (NGS) e tecnoloxías de análise funcional (metiloma, ATAC-seq, chip-seq), permitindo analizar a totalidade do xenoma ou rexións específicas para dar solucions mais eficientes en proxectos de tipo aplicado ou básico.
Plataforma de Servizos Xenéticos e Xenómicos
Facultade de Veterinaria Pavillón 2 planta 0
Avda. Carballo Calero s/n, 27002 Lugo
Investigadores responsables
• Belén Gómez
belen.gomez [at] usc.es (belen[dot]gomez[at]usc[dot]es)
Ext.- 22234 (externos 982822234)
• Paulino Martinez
paulino.martinez [at] usc.es (paulino[dot]martinez[at]usc[dot]es)
Ext.- 22425 (externos 982822425)
Técnico de investigación
• Lucía Insua
lucia.insua [at] usc.es (lucia[dot]insua[at]usc[dot]es)
Ext.- 22228 (externos 982822228)
Responsable de xestión
• Mónica A. Otero
monicaafrica.otero [at] usc.es (monicaafrica[dot]otero[at]usc[dot]es)
Ext.- 22427 (externos 982822427)
Plataforma de Servizos Peixe Cebra
Facultade de Veterinaria Pavillón 2 planta 0
Avda. Carballo Calero s/n, 27002 Lugo
Investigadora responsable
• Laura E. Sánchez Piñón
lauraelena.sanchez [at] usc.es (lauraelena[dot]sanchez[at]usc[dot]es)
Ext.- 22429 (externos 982822429)
Investigadora asociada responsable do acuario Peixe cebra
• Marina Pampín Iglesias
marina.pampin.iglesias [at] usc.es (marina[dot]pampin[dot]iglesias[at]usc[dot]es)
Ext.- 22428 (externos 982822428)
Actualmente, os servizos da Plataforma inclúen:
- Asesoramento xenético e xenómico, elixindo tecnoloxías adecuadas para cada proxecto.
- Toma e procesamento de mostras, extracción e cuantificación de ácidos nucleicos, e construción de librerías NGS.
- Xenotipado a escala de SNPs (< 100, < 1000, miles)
- Análise bioinformática de datos: procesado, ensamblaxe, aliñamento e anotación das secuencias.
- Interpretación dos resultados obtidos e orientación para futuras investigacións.
En 2014, a Plataforma incorporou o uso do peixe cebra como modelo experimental en toxicoloxía e biomedicina, cunha instalación para 1800 vertebrados acuáticos (peixe cebra e killifish). Esta instalación permite a cría e estudo de diversas variantes de peixes cebra, con amplas implicacións na bioloxía do desenvolvemento e a evolución.
A Plataforma conta cun laboratorio completamente equipado para desenvolver proxectos de colaboración, contratos con empresas e grupos de investigación, e para a avaliación da toxicidade de compostos empregados na industria e na sanidade.
(Máis abaixo, na sección Actividades relacionadas, pódense consultar a relación de servizos prestados polas diferentes Unidades de Plataforma).