Créditos ECTS Créditos ECTS: 3
Horas ECTS Criterios/Memorias Traballo do Alumno/a ECTS: 51 Horas de Titorías: 3 Clase Expositiva: 9 Clase Interactiva: 12 Total: 75
Linguas de uso Castelán, Galego
Tipo: Materia Ordinaria Máster RD 1393/2007 - 822/2021
Departamentos: Zooloxía, Xenética e Antropoloxía Física
Áreas: Xenética
Centro Facultade de Bioloxía
Convocatoria: Segundo semestre
Docencia: Con docencia
Matrícula: Matriculable | 1ro curso (Si)
Fornecer unha introducción as técnicas de:
Estimación dos parámetros xenéticos das poboacións
Avaliación xenética de reprodutores baseada en fenotipos y en información xenómica.
Selección artificial
Deseño de plans de millora xenética
Temario teoría
Tema 1: Introducción á Mellora Xenética e a Xenética cuantitativa. Descomposición do valor fenotípico. Valor reproductivo.
Tema 2: Estimación da heredabilidade e resposta a selección.
Tema 3: Avaliación xenética baseada en fenotipos.
Tema 4: Combinación de distintas fontes de información: indices de selección e BLUP.
Selección multicarácter
Tema 5: Avaliación xenética baseada en xenotipos e selección xenómica
Tema 6: Estructura e desenho de un plan de mellora xenetica.
Temario Prácticas
Simulación en ordenador dos procesos de avaliación xenética de reproductores e selección artificial.
Bibliografía básica:
Caballero A (2017) Genética Cuantitativa. Editorial Síntesis, Madrid.
Falconer DS, Mackay TFC (1996). Introduction to Quantitative Genetics. Longman: Harlow Essex, England
Gjedrem, T & Baranski M, 2009. Selective breeding in aquaculture: an introduction. Springer, Dordrecht
Sonesson, A.K. Genomic Selection for Aquaculture: Principles and Procedures. In: Z. J. Liu (Ed) Next Generation Sequencing and Whole Genome Selection in Aquaculture © 2011 Blackwell Publishing Ltd. ISBN: 978-0-813-80637-2
Bibliografía complementaria:
Abdelrahman et al. (2017) Aquaculture genomics, genetics, and breeding in the United States: current status, challenges, and priorities for future research. BMC Genomics 18:91 https://doi.org/10.1186/s12864-017-3557-1
Bao, Z (2011) Comparison of Index Selection, BLUP, MAS, and Whole Genome Selection. In JL Zhanjiang (Ed.) Next Generation Sequencing and Whole Genome Selection in Aquaculture © 2011 Blackwell Publishing Ltd. ISBN: 978-0-813-80637-2
Farias TF, César JRDO, Silva LPD (2017) Methods of Selection Using the Quantitative Genetics in Aquaculture-A Short Review. Insights Aquac Cult Biotechnol. 2017, 1:1.
Fernández J, Toro MA, Sonesson AK, Villanueva B (2014) Optimizing the creation of base populations for aquaculture breeding programs using phenotypic and genomic data and its consequences on genetic progress. Front Genet 5: 414.
Gjedrem T., and Rye M. (2016). Selection response in fish and shellfish: a review. Rev Aquacult 10:168-179.
Hill, WG, (2010) Understanding and using quantitative genetic variation. PHIL Trans R Soc B 365: 73-85.
Jones HE, Wilson PB. Progress and opportunities through use of genomics in animal production. Trends Genet. 2022 Dec;38(12):1228-1252. doi: 10.1016/j.tig.2022.06.014. Epub 2022 Aug 6. PMID: 35945076.
Meuwissen, T, Hayes, B, Goddard, M (2016) Genomic selection: A paradigm shift in animal breeding, Animal Frontiers, 6(1): 6–14, https://doi.org/10.2527/af.2016-0002
O'Flynn FM, Bailey JK, Friars GW (1999) Responses to two generations of index selection in Atlantic salmon (Salmo salar). Aquaculture 173:143-147.
Palaiokostas C, Kocour M, Prchal M, Houston RD (2018) Accuracy of Genomic Evaluations of Juvenile Growth Rate in Common Carp (Cyprinus carpio) Using Genotyping by Sequencing. Frontiers in Genetics 9:82.
Sotkstad, E. (2022) Tomorrow’s catch. Science 370 (6519): 902-905.
Small BC, Hardy RW, Tucker CS (2016) Enhancing fish performance in aquaculture. Animal Frontiers 6:42-49.
Taylor JF (2014) Implementation and accuracy of genomic selection. Aquaculture 420-421, S1: S8-S14.
Zenger, KR, Khatkar, MS, Jones, DB,Khalilisamani, N, Jerry, DR, Raadsma, HW (2019). Genomic Selection in Aquaculture: Application, Limitations, and Opportunities With Special Reference to Marine Shrimp and Pearl Oysters. Frontiers in Genetics 9 https://doi.org/10.3389/fgene.2018.00693
Recursos web:
Bases de datos xenómicos; Xenomas animais e de especies en acuicultura; Ferramentas de bioloxía molecular; Recursos de análise de ligamento e mapeo xenético; recursos sobre microarrays; Mapeo comparativo. Mapeo QTL.
http://www.ensembl.org/
http://www.animalgenome.org/aquaculture/
https://www.biostat.wisc.edu/~kbroman/teaching/misc/Jax/2005/rqtltour.p…
Outros materiais de apoio:
Simulación en ordenador
Competencias xerais:
• CX03- Valorar a importancia das análises multidisciplinares e a relación entre coñecementos para a resolución de problemas e para análises de puntos críticos.
• CX04- Utilizar as terminoloxías científicas axeitadas.
• CG08- Potenciar o manexo de idiomas extranxeiros.
Competencias específicas:
• CE10- Identificar obxectivos relevantes de investigación e planificar a súa consecución.
• CE11- Adquirir os coñecementos básicos e aplicados de xenética, xenómica e proteómica aplicada á acuicultura.
Competencias básicas:
• CB02- Garantirase que o estudantado saiba aplicar os coñecementos adquiridos e a súa capacidade de resolución de problemas en contornas novas ou pouco coñecidas dentro de contextos máis amplos (ou multidisciplinares) relacionados coa sua área de estudo.;
Competencias transversais:
• CT2 - Capacidade de traballo autónomo e toma de decisións.
• CT4 - Habilidade na búsqueda, análise e interpretación de fontes de información variadas e en distintos idiomas (fundamentalmente inglés).
--Clases presenciais teóricas e de seminarios. Presentación multimedia.
-Clases prácticas presenciaies: Simulación en ordeador dos procesos de avaliación xenética e selección artificial. As prácticas impartiranse na USC, Campus Vida (1 día).
-Titorías personalizadas: Resolución de dúbidas e apoio á consecución de obxetivos popostos na asginatura.
Consideracións xerais:
Avaliación da adquisición de competencias específicas e xerais propostos na asignatura.
Aspectos e criterios de avaliación:
Examen (70%); prácticas (asistencia, aproveitamento; 20%); Asistencia e participación (10%)
Orientacións ó estudio:
Asistir ás clases de teoría, prácticas e seminarios. Consultar a bibliografía recomendada. Empregar a titorías. Participar nas clases. Estudar de xeito regular.
Horas non presenciais 51
Asistir ás clases de teoría, prácticas e seminarios. Consultar a bibliografía recomendada. Empregar a titorías. Participar nas clases. Estudar de xeito regular.
Para os casos de realización fraudulenta de exercicios ou probas será de aplicación o recollido na "Normativa de avaliación do rendemento académico dos estudantes e de revisión de cualificacións”
Carlos Garcia Suarez
Coordinador/a- Departamento
- Zooloxía, Xenética e Antropoloxía Física
- Área
- Xenética
- Teléfono
- 881816903
- Correo electrónico
- carlos.garcia.suarez [at] usc.es
- Categoría
- Profesor/a: Catedrático/a de Universidade