La primera fase del edificio de la ETSE se inauguró en febrero de 2001. El 24 de mayo de 2002 se publicó en el Diario Oficial de Galicia la creación de la ETSE, y en febrero de 2003 acabaron las obras del edificio actual. En ese mismo mes se adscribieron al centro la titulación de Ingeniería Química y el Departamento de Ingeniería Química. A lo largo del curso 2002-2003 se completó la puesta en marcha de las actividades docentes y el traslado de los grupos de investigación del Departamento de Ingeniería Química.
La actual oferta docente del centro consta de una serie de títulos de grado y máster, en los ámbitos de la Ingeniería Informática, Inteligencia Artificial e Ingeniería Química. En el curso 2003-2004 comenzó a impartirse en la ETSE la titulación de Ingeniería Técnica en Informática de Sistemas. En el curso 2007-2008, el título propio de Graduado/a Superior en Ingeniería Ambiental se transformó en el Máster Universitario de Ingeniería Ambiental. En el curso 2009-2010, comenzó a impartirse el Grado en Ingeniería Informática, en el curso 2010-2011 el Grado en Ingeniería Química y en el curso 2022-2023 comienza a impartirse el Grado en Inteligencia Artificial, completándose de esta forma la actual oferta de estudios de grado.
La oferta de másteres termina de definirse con la puesta en marcha del Máster Interuniversitario en Computación de Altas Prestaciones y del Máster Universitario en Ingeniería de Procesos Químicos y Ambientales en el curso 2010-2011, el Máster Universitario en Tecnologías de la Información en el curso 2011-2012, el Máster Universitario en Ingeniería Química y Bioprocesos en el curso 2013-2014, el Máster en Big Data en el curso 2015-2016, el Máster en Visión por Computador en el curso 2020-2021, el Máster en Inteligencia Artificial en el curso 2022-2023 y el Máster en Gestión Sostenible del Agua en el curso 2023-24. Además, en el curso 2015-2016 se comenzó a impartir el Doble Grado en Ingeniería Informática y Matemáticas.